JAMA聚焦感染病：腹泻诊疗指南+二代测序快速诊断 | 热心肠日报

今天是第1015期日报。

JAMA：感染性腹泻诊断与治疗新指南

JAMA[IF:44.405]

① 对于腹泻发热、便血、严重腹痛或脓毒症患者，建议采用分子学和培养鉴定法进行沙门氏菌、志贺氏菌、弯曲杆菌、耶尔森菌、艰难梭菌和产毒大肠杆菌的粪便检测；② 当病原菌的药物敏感性影响疾病治疗和公共卫生安全时，建议采用粪便培养检测；③ 不建议对不复杂的腹泻感染病例进行诊断测试；④ 免疫功能正常但没有脓毒症的带血痢疾患者，建议避免使用抗生素；⑤ 益生菌对缓解急性感染性腹泻的作用尚不明确，需要进一步研究后再采取辅助治疗建议。

Diagnosis and Management of Infectious Diarrhea
02-14, doi: 10.1001/jama.2018.21974

【主编评语】感染性腹泻是全球第五大致死原因。JAMA近期发表了美国传染病学会（IDSA）主导的感染性腹泻诊断与治疗指南，对感染性腹泻防控具有指导意义。（@小肠）

JAMA：二代测序技术在感染性病原体检测中的优势及展望

JAMA[IF:44.405]

① 与传统方法相比，二代测序（NGS）具有快速、准确和高精度等优点，有望改善临床和公共卫生微生物学；② NGS可快速、高通量地监测疾病爆发，可整合病原体基因组学与流行病学从而促进传染病预防，可快速检测耐药性以进行特异性治疗，易于标准化和实现数据共享；③ NGS临床应用的障碍包括基础设施和人力成本，并需要建立标准的流程、效能测试、专业指导及相关法规；④ NGS病原菌检测技术的运用需要考虑对患者、机构和社会的影响。

Next-Generation Sequencing of Infectious Pathogens
02-14, doi: 10.1001/jama.2018.21669

【主编评语】随着测序技术和数据分析方法的发展，运用于科研领域的二代测序技术有望广泛应用于临床病原体检测。本文简要介绍了二代测序进行病原体检测的流程，指出了该技术的优势、局限性以及未来的发展方向，值得参考。（@小肠）

Nature子刊：运用二代测序技术准确、快速诊断感染疾病

Nature Microbiology[IF:14.174]

① 运用二代测序检测技术，鉴别并定量血液中1250种与临床相关的细菌、DNA病毒、真菌和真核寄生虫，可利用血液中游离微生物DNA，准确、快速地诊断多种感染；② 该测序检测与血液培养检测结果的一致性达到93.7% ，比其他检测方法更有效地找到脓毒症致病菌；③ 用其他检测技术确诊地166名无脓毒症风险的病人中，该测序技术从62人中检测到游离微生物DNA，可能来自于共生菌且与脓毒症无关；④ 超过85%的检测报告隔日可见，53.7%报告检测出微生物。

Analytical and clinical validation of a microbial cell-free DNA sequencing test for infectious disease
02-11, doi: 10.1038/s41564-018-0349-6

【主编评语】对血液中游离微生物DNA进行测序，有望作为非侵入性检测方法用于感染疾病检测。本研究分析并验证了二代测序技术运用于病原体检测的有效性，证明该技术在诊断感染性疾病方面准确、快速，适用于临床诊断。（@小肠）

鉴定儿童肠道致病菌的粪便检测指南，仍需优化

Clinical Infectious Diseases[IF:9.117]

① 纳入加拿大2447名腹泻/呕吐儿童，检测9种肠道致病菌以评估6个代表性粪便检测指南的差异；② 从6%的患儿中检测到致病菌，沙门氏菌、气单胞菌和弯曲杆菌最常见；③ 这些指南的敏感性为25.8%~66.9%，特异性为63.9%~96.5%，敏感性最高和特异性最高的指南分别存在1/3和3/4漏诊病例；④ 需优化现有指南，平衡敏感性和检测量，考虑患者就诊时的所有相关信息，优先检测在临床或公共卫生方面的重要致病菌，并将仅有呕吐症状的患者纳入检测人群。

Performance of Stool Testing Recommendations for Acute Gastroenteritis when Used to Identify Children with Nine Potential Bacterial Enteropathogens
2018-12-04, doi: 10.1093/cid/ciy1021

【主编评语】对胃肠炎儿童致病菌的粪便微生物学检测，现行的多个指南间存在不一致的建议。Clinical Infectious Diseases近期发表研究，在近2500名有胃肠炎症状的儿童中，评估6个现行指南的表现，并对改进方向提出了建议。（@李丹宜）

BMJ：肠道病毒或是乳糜泻幕后黑手

British Medical Journal[IF:23.259]

① 纳入220名具有高乳糜泻风险的挪威儿童，在跟踪10年内有25名儿童发生乳糜泻，发病平均年龄为9.9岁；；② 在3-36月龄采集到的粪便样品中，17%含有肠道病毒（EV）；③ 在接触过麸质饮食后，与对照组相比，EV在产生乳糜泻抗体前收集的样品中更为普遍；④ 粪便中EV含量越高、感染持续时间越长，则乳糜泻发病风险越高；⑤ 常见的A型和B型EV均与乳糜泻发病风险显著相关；⑥ 腺病毒以及乳糜泻抗体产生之后的EV感染，与乳糜泻风险缺乏相关性。

Enterovirus as trigger of coeliac disease: nested case-control study within prospective birth cohort
02-13, doi: 10.1136/bmj.l231

【主编评语】感染可能影响儿童乳糜泻的发病。本研究发现，幼年期大量、长期的肠道病毒感染与后期乳糜泻发病相关，该相关性不涉及腺病毒。该结果指出了病毒感染可能参与乳糜泻发病，值得参考。（@小肠）

Cell：慢性炎症永久性地改变肠道免疫系统

Cell[IF:31.398]

① 在乳糜泻中，由膳食蛋白抗原引起的慢性炎症状态会永久地改变肠道上皮中先天样TCRγδ+上皮内淋巴细胞（IEL）群的组成；② 先天样γδ1+ IEL对嗜乳脂蛋白样分子BTNL3/BTNL8具有特异性反馈，乳糜泻时该IEL被表达干扰素γ的γδ1+ IEL代替；③ 乳糜泻时，γδ1+ IEL的T细胞受体（TCR）库发生了永久性变化，无法识别BTNL3/BTNL8；④ 缺少BTNL8，会导致先天样γδ1+ IEL在乳糜泻时永久消失，减少膳食蛋白恢复BTNL8表达无法恢复先天样γδ1+ IEL。

Chronic Inflammation Permanently Reshapes Tissue-Resident Immunity in Celiac Disease
02-05, doi: 10.1016/j.cell.2018.12.039

【主编评语】肠道组织驻留型淋巴细胞在免疫监视过程中具有重要作用。Cell近期发表研究，阐释了在乳糜泻病变中，由食物蛋白抗原引的慢性炎症永久性地改变了上皮内淋巴细胞类型。该研究对研究慢性炎症过程中的肠道免疫系统变化具有参考价值。（@小肠）

粪菌移植治疗原发性硬化性胆管炎

American Journal of Gastroenterology[IF:10.231]

① 纳入10名原发性硬化性胆管炎（PSC）患者（并发IBD，9名溃疡性结肠炎、1名克罗恩病），进行单次经结肠镜的粪菌移植的非盲临床试验；② 在移植后第1、4、8、12、24周分析肝脏酶谱、粪便菌群及粪便代谢组；③ 患者的碱性磷酸酶（ALP）平均基线水平为489U/L；④ 无粪菌移植相关不良事件发生，3名患者（30%）的ALP水平降低了50%以上；⑤ 所有患者的粪便菌群多样性在移植后增加，供体菌群在患者体内的成功定殖于ALP的降低相关。

Fecal Microbiota Transplantation in Patients With Primary Sclerosing Cholangitis: A Pilot Clinical Trial
01-31, doi: 10.14309/ajg.0000000000000115

【主编评语】American Journal of Gastroenterology上发表的一项临床试验结果，在10名原发性硬化性胆管炎合并IBD的患者中，粪菌移植治疗表现出较好的安全性，且在部分患者中可有效地降低碱性磷酸酶水平。（@沈志勋）

Lancet子刊：咪唑硫嘌呤或增加IBD患儿的急性胰腺炎风险

The Lancet Child & Adolescent Health[IF:N/A]

① 纳入3574名咪唑硫嘌呤（一种免疫抑制剂）及18700名非使用者，受试者均为18岁以下、来自瑞典及丹麦的IBD患者；② 选取各类指标相匹配的3374对咪唑硫嘌呤使用者/非使用者进行分析，其中1923名为克罗恩病患者，其余1451名为溃疡性结肠炎或未分类IBD患者；③ 在开始使用咪唑硫嘌呤后的90天内，使用者中有40例急性胰腺炎发生，而非使用者中有6例；④ 咪唑硫嘌呤的使用与急性胰腺炎的风险升高相关。

Association between use of azathioprine and risk of acute pancreatitis in children with inflammatory bowel disease: a Swedish–Danish nationwide cohort study
01-23, doi: 10.1016/S2352-4642(18)30401-2

【主编评语】The Lancet Child & Adolescent Health上发表的一项最新队列研究结果，发现在IBD患儿中，使用咪唑硫嘌呤治疗与急性胰腺炎的风险增加相关。（@沈志勋）

感谢本期日报的创作者：徐笑，张玲，小肠，沈志勋

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